是否应该将东非猎豹作为一个独立亚种

东非猎豹与索马里猎豹的关系：使用全基因组数据分析时，东非猎豹（A. j. raineyi）与索马里猎豹（A. j. soemmeringii）的关系比与南非猎豹（A. j. jubatus）更近，尽管东非猎豹之前被归为南非猎豹的一个亚种。这表明，在全基因组层面上，东非猎豹与索马里猎豹之间的遗传差异较小。 基因流动：通过分析混合程度和有效迁移率，发现猎豹亚种之间几乎没有或只有有限的基因流动。这意味着它们各自保持着相对独立的遗传特征。 线粒体DNA异常：有两个被全基因组核SNP数据归类为索马里猎豹的个体，却携带了东非猎豹的线粒体单倍型。但这两个个体并没有显示出近期混合的迹象，这可能意味着这种差异是由于线粒体DNA的不完全谱系分选（即历史遗传信息未完全分离）造成的，而不是因为两种猎豹亚种之间的混合。 地理分布：大多数猎豹亚种在地理分布上是分隔的，但东非猎豹和索马里猎豹的分布区域可能有所重叠（称为邻接分布）。 单系性：基于核DNA数据的系统发育树重建显示，这五个猎豹亚种都是单系的，即每个亚种在进化树上形成了一个独立的分支。这进一步支持了它们作为独立亚种的地位。同时，大多数基于线粒体DNA数据的单倍型网络重建也显示了类似的模式。 遗传变异分配：使用线粒体DNA数据的层级AMOVA分析表明，猎豹亚种之间的遗传变异占总体变异的很大比例（85%），而种群内部的变异较小（15%）。然而，由于目前没有适用于低覆盖度数据的工具，因此无法对全基因组SNP数据进行类似的层级AMOVA分析。