唐武德元年（618年），李渊率兵攻克长安（今陕西西安），同年五月，李渊接受隋恭帝禅让称帝。六月，李世民授封为秦王。杜如晦被秦王李世民引为秦王府兵曹参军，不久升任陕州（今河南三门峡西）总管府长史。当时府中有很多英才被外迁，房玄龄向秦王李世民推荐杜如晦，说他是辅佐帝王的人才。秦王李世民上奏留下杜如晦，担任秦王府属官。后来杜如晦跟随唐太宗征伐薛仁杲、刘武周、王世充、窦建德，参议军国机要，杜如晦剖断如流，深受同僚佩服。升迁至陕东道大行台司勋郎中，封建平县男，食邑三百户，并兼任文学馆学士。武德四年（621年），秦王李世民建天策府，任杜如晦为从事郎中，为十八学士之首。
