康熙五十九年（1720）八月，清军两路入藏战役进入决胜阶段。南路军参将岳钟琪率五千先锋突进至拉萨城东郊，以八十门劈山炮轰塌东南角城墙。入城部队按战前部署，重点控制大昭寺、小昭寺及布达拉宫火药库，缴获准军储存的瑞典造燧发枪四百支。为震慑敌对势力，岳钟琪下令处决甘丹寺参与军械铸造的七十四名喇嘛，其中五名转世活佛被押赴八廓街行刑，此事件被藏文档案称为"铁虎之劫"。 北路军统帅延信在当雄草原构筑立体防御体系：外层设拒马桩三百架，中层挖堑壕三道引雪水灌注，内层垒石墙高两丈。大策凌敦多克于八月廿四日夜率两千精骑突袭，准军骑兵马蹄裹毡，试图悄近清营。但延信提前埋设的地听瓮捕捉到三里外震动，清军佛郎机炮装填链弹实施拦截射击，击毙准军先锋巴图尔贝子。 九月初三，岳钟琪部控制拉萨全城，派快马向延信传递合围信号。大策凌敦多克率残部一千八百人退守纳木错西岸，利用湖面结冰期架设移动冰垒。清军采用凿冰战术，以铁锥破坏冰面承重结构，迫使准军放弃重型火炮。九月十七日黎明，准军分三路突围，仅十七骑穿越羌塘无人区，历时五十三天返回伊犁，创下日均奔袭百里的生存奇迹。 战后安置工作随即展开。雍正元年（1723）正月，清廷废除和硕特汗王体系，设噶伦四人共治：康济鼐掌阿里兵马，阿尔布巴理前藏民政，隆布鼐管后藏粮饷，扎尔鼐司司法刑狱。四人金印均重九斤十三两，印匣特设满藏双锁，需驻藏大臣与达赖代表同时启封。 这也标志着清朝正式管辖西藏地区。从此，雪域高原120平方公里正式纳入中华版图。 青海方面，罗卜藏丹津于雍正元年三月收到朝廷"青海亲王"虚衔册封，但实控地域被压缩至青海湖西岸。清廷同时推行蒙制度改革，将和硕特二十一旗拆分为二十九佐领，各佐领互不统属。雍正二年（1724）正月，罗卜藏丹津于察罕托罗海会盟反清，点燃青海之乱导火索。
