1946年3月，北平医院，戴笠的突然来访，令准备接受肾脏切除手术的杜聿明倍感意外。
彼时，身兼东北保安司令长官的杜聿明正因病痛缠身，不得不接受手术。而军统头子戴笠却正忙于在平津地区处理战后事务：接收资产、肃清汉奸，可谓焦头烂额。3月13日，军统东北督查室主任文强的密电却改变了戴笠的行程。密电内容显示，杜聿明已入院，即将动手术。15日，戴笠结束天津事务后，便马不停蹄赶往北平，并抽空探望了杜聿明。尽管两人交往不多，但彼此并无嫌隙。杜聿明善于周旋，与军统表面上保持着良好关系。1945年春，戴笠曾托付沈醉，将一批美援物资转运至重庆军统总部。杜聿明不仅爽快答应，还亲自安排此事，并设宴款待沈醉。事后，戴笠赞扬杜聿明处事圆滑，与一些对军统态度冷淡的黄埔一期将领截然不同。戴笠此行北平，除了私人情谊，更有深层考量。杜聿明统领东北二十多万军队，在黄埔一期将领中仅次于胡宗南，戴笠希望能借此机会巩固双方的关系，为军统在东北开展工作铺平道路。
在中和医院，戴笠见到杜聿明后，表达了关切之情，详细询问了手术安排。得知主刀医生谢元甫年逾花甲后，戴笠表达了担忧，甚至提及自己曾因年长医生手术不满意而产生的不良体验，力劝杜聿明更换主刀医生。杜聿明虽有些犹豫，但最终还是同意了戴笠的建议，戴笠当晚便拜访了谢元甫。由于军统在北平声名在外，谢家人一度心生担忧，经杜聿明解释后才放下心来。戴笠与谢元甫彻夜长谈，详细了解了手术方案后，最终同意由谢元甫主刀。其实，戴笠北平之行并非单纯探望杜聿明，他秘密会见了华北地区军统骨干，布置了情报收集和破坏任务，并整顿了北平军统特务在“肃奸”过程中的贪污问题，甚至牵扯到军统北平站站长马汉三。处理完这些事务后，戴笠前往南京，再转往重庆。临行前，他又探望了术后康复中的杜聿明，谁知，这竟是两人最后一次见面。3月17日，戴笠的飞机在南京附近坠毁，一代特务头子就此陨落。戴笠的死引发了连锁反应。
军统改组为保密局后，郑介民和毛人凤对文强颇为不满，但因杜聿明的支持，文强依然在军统系统内稳固地位。1947年9月，陈诚取代熊式辉，杜聿明失去东北保安司令长官的职位，移居上海休养。杜聿明失势后，文强也离开了军统，投奔程潜。陈诚对军统素来不感冒，其赴东北后，保密局活动大受限制，这也预示着军统势力的衰落。
