2017年，打着“清算积弊”和“公平”的旗号上台的文在寅在就任总统后立即任命尹锡

2017年，打着“清算积弊”和“公平”的旗号上台的文在寅在就任总统后立即任命尹锡悦为检察机关的核心职位——首尔中央地方检察厅检察长。上任之初，尹锡悦恢复了对国家情报院舆论操纵案的调查，对上届政府中妨碍调查的前国防部长金宽镇进行了拘捕起诉。2018年，尹锡悦领导的检察机关拘留了李明博政府的亲信金镇模和前秘书官金伯俊，搜查了Das公司职员的住宅、李相得的住宅和永浦大厦等，并于3月22日拘捕了前总统李明博。虽然在总体上相关调查得到了国民的支持，但尹锡悦也因在1年内拘捕来自保守派的两位前总统而被视为摧毁保守阵营的罪魁祸首。 2018年，尹锡悦领导的首尔中央地方检察厅对大法院滥用司法权进行调查。大法院为了保护自身，陆续驳回对参与事件的团体和人物的扣押搜查令。在大法院表现出不合作的态度后，尹锡悦下达了"无法理解大法院的应对""要按照法律彻底调查"的指示，检察厅的调查力度进一步加大。次年1月24日，首尔中央地方法院签发了检察机关申请的梁承泰逮捕令，梁承泰成为“宪政史上第一位被拘留的大法院院长”。