如果没有那两个原子弹，日本不会那么快投降；按照冲绳之战的模式，以及当时日本已经做好全民玉碎的动员，完全变成一个可怕的战争机器。美军登陆日本本土之后，会遭到猛烈的抵抗，阵地战、游击战、地道战，日军、日本民众和美军都会死伤惨烈，还会影响到中国等其他战场的无辜民众。
详细来说：
冲绳之战打了82天，美军伤亡总数5万人，日军11万人绝大部分阵亡，民众死亡10-15万人，而且许多平民并非死于直接交火，而是由于日军的“玉碎令”被迫集体自杀，或被日军当作肉盾。
如果原子弹没有投掷，盟军原定于1945年11月开启登陆日本本土的军事行动，根据冲绳战役中日军表现出的自杀式抵抗，美军参谋长联席会议预估，登陆作战可能导致美军至多100万人的伤亡。
当时日本已通过《义勇兵役法》，动员了约2800万平民组成“国民义勇战斗队”，准备用竹枪和肉搏战对抗美军。如果战争进入本土肉搏阶段，日本平民的死伤将以千万计。
当时的日本确实已经变成了一个极端的战争机器：• 神风特攻扩大化： 日本计划在本土防御中投入超过10,000架自杀式飞机。• 防御深度： 日军在九州等登陆预定地部署了远超美军情报预期的兵力。• 洗脑教育： 军部宣传“一亿玉碎”，导致民众普遍认为投降是比死亡更可怕的耻辱。
而且还要考虑到中国战场。如果战争拖延下去，沦陷区苦难延续： 即使日军在本土防守，但在中国东北、华北及东南亚仍驻扎着大量日军。战争每多持续一个月，这些沦陷区因饥荒、屠杀和劳役死去的平民数量都是巨大的。如果驻华日军在本土沦陷之后陷入疯狂状态，很难说会不会出现大规模屠杀中国军民的情况，毕竟日本法西斯毫无疑问是最没有人性的军队。
奥本海默远在美国本土搞研发，没有体验到战场的残酷，也不了解全战争的具体进展，在如何结束战争的问题上，他显然没有美国总统以及高级将领有全局战略。他只是看到原子弹的巨大威力，因此产生了负罪与恐惧感，担忧人类未来会毁于核战。他的良知和原子弹有效提前结束二战并不矛盾。
