1950年，孙立人时常为公务与重要官员、重要将领公开争吵，比如与蒋经国就屡屡发生争吵。张佛千就劝他，说：“你跟蒋经国拍桌子吵架都没有关系，但你能不能在公开场合表个态，说说蒋经国这个人很好、很努力。只要你说了，就会传到蒋经国耳朵里，这样至少可以缓解你们之间的紧张关系。”，孙立人说：“那我试试看。”，但实际上，他根本没听进去。 1949年蒋介石带领国民党仓皇逃亡台湾后便在此“安营扎寨以待来时”。许多从大陆逃亡台湾的国民党军官及其家人因为“占地盘”的纷争纷纷与国民党负责总务工作的蒋经国闹的很不愉快。 孙立人就是其中之一，这个曾经作为国民党和美国对接的主要负责人就非常不满意国民党撤退到台湾后的军事战略部署及安排。 作为美国军校出身的孙立人其实一直都瞧不上蒋经国关于军队战略事务的相关安排，认为这个没有任何带兵打仗经验的“二世祖”只不过仗着是蒋介石的儿子才能在国民党中稳坐接班人位置而已。国民党军队搞不好早晚就要败在这个二世祖的手上。 因此在台湾稳定下来后的孙立人及时长在公务安排和军队部署问题上公开和蒋经国发生了数次争吵闹的十分不愉快。 尤其是在美国方面秘密向蒋介石提供一份特情情报后，蒋介石对于孙立人的不满更是达到了顶峰。蒋介石本就在培养儿子蒋经国在做接班人了，这个刺头却处处刺向蒋经国，于是他也暗自行动起来准备收拾了孙立人。 孙立人的好友张佛千敏感地察觉到了蒋介石这微小的变化，于是他赶紧提醒起老友来，劝老友低一低头。毕竟蒋经国是未来正儿八经的“继承人”，这个时候不要闹的太僵以免后续挨整。 张千佛还细心地提醒老友，你可以不喜欢蒋经国也可以和他对着干，但是不管是不喜欢还是对着干都不能放在明面上。相反在人多的地方你只能说他好，这些话早晚会传到蒋经国耳朵里，他要的就是你的公开表态而已。 孙立人听了好友的话后表示自己会为了将来做打算的。但是他私下里却依旧是美式的思想对于这种中国式思维的人情世故很不屑。这也为他后续埋下了祸根。 美国中情局告诉蒋介石孙立人可能会发动政变，再加上孙立人平时和蒋经国不小的争执让蒋介石认为他真的已经开始了“反蒋”。 1955年6月蒋介石在台湾阅兵时候借着美国情报对孙立人开始进行“攻击”，以其有共党嫌疑将其撤职软禁起来。 孙立人没想到，他的软禁时间竟然会高达33年之久。蒋介石去世后蒋经国对于他的控制仍在继续，直到1988年蒋经国也去世后，孙立人才重新获得自由。
