日本石破茂内阁全体辞职高市早苗担任日本首相后，预计将对中日关系带来多方面的负面影响：
高市早苗具有明显的右翼甚至极右翼民族主义倾向，她曾多次以大臣身份参拜靖国神社，公开支持 “拜鬼” 行为。靖国神社供奉着二战期间的甲级战犯，参拜靖国神社这种行为严重伤害了包括中国在内的亚洲受害国人民的感情。如果她以首相身份继续参拜靖国神社，必将引发中方的强烈反制，导致中日两国政治互信进一步下降，双边关系短期内急剧降温。
高市早苗在台湾问题上言辞激进，她率团前往台湾与领导人赖清德会面，宣称 “台海若有事将关乎日本生死存亡”，复刻安倍晋三 “台湾有事即日本有事” 的论调。她还表示绝不允许任何势力 “凭实力胁迫和单方面改变台海现状”，这种危险的言论和行为是对中国内政的严重干涉，可能会让日本在台海冲突中的介入意愿和行动力超过前任，极大地加剧台海地区的紧张局势，严重破坏中日关系的政治基础。
高市早苗主张日本修宪，要求删除日本宪法第九条中 “放弃交战权” 和 “不保持战争力量” 的条款，将自卫队改名为 “国防军”，赋予日本武装力量 “先发制人” 的进攻权。她的这些修宪和扩军主张，旨在实现日本的军事正常化，推翻日本战后和平秩序的根基。日本的军事扩张行为将对中国的安全构成直接威胁，加剧东亚地区的安全紧张局势，导致中日关系在安全领域的对抗进一步升级。
高市早苗强调强化美日同盟，谋求两国间实现类似北约的核武器共享机制，甚至不排除允许美军在日本本土部署核武器。她还可能推动美日韩 “小北约” 的形成，在地区安全上更紧密地靠拢美国。这种外交政策上的倾向，将使日本在对华政策上更倾向于配合美国的战略，在印太地区加强与中国的对抗，从而给中日关系带来更大的外部压力，使中日关系在复杂的国际格局中面临更多的不确定性和挑战。
高市早苗的保守政策导向可能会使日本在经济领域采取一些不利于中日合作的举措，她可能会推动日本在半导体设备等高科技领域与中国的选择性脱钩，试图在经济上对中国进行遏制。这将损害中日两国经济高度互依的现实利益，破坏中日产业链供应链的稳定性，给中日经贸合作带来阻碍，影响两国在绿色经济、医疗康养等领域的合作前景。
不过，中日经济高度互依的现实以及日本国内部分势力对稳定对华关系的诉求，可能会对高市早苗的强硬政策形成一定的制约，使她在实际政策执行中不得不有所顾忌，这也为中日关系的发展保留了一定的缓冲空间。
