2000赛季，在某些媒体的报道中，桑特拉奇的执教风格变得专断而固执。他不再像上赛季那样倾听助手意见，训练中频繁斥责队员，即使是宿茂臻、李霄鹏等核心球员也难逃批评。有队员回忆，他时常在训练场上因微小失误大发雷霆，甚至用“你们的技术不如南斯拉夫的小学生”这样的言语打击球员自信。 更致命的是，他放弃了上赛季赖以成功的务实战术，盲目追求“攻势足球”，导致球队攻守失衡。2000赛季首轮，鲁能便主场0-1不敌云南红塔，随后战绩起伏不定，前八轮仅取得3胜3平2负的成绩，与上赛季的势如破竹形成鲜明对比。 场外的权力斗争彻底点燃了导火索。2000年夏天，桑特拉奇与俱乐部的矛盾全面爆发。他坚持要求引进自己推荐的南斯拉夫球员，遭到俱乐部否决后，公开在新闻发布会上表达不满；训练中与助理教练发生争执时，他竟直接让对方“滚出训练场”；更有媒体曝光，他因不满队员体能状态，在训练中采取高强度体罚，导致多名主力球员受伤，影响球队战绩。 此时的他，早已失去了球员的信任——宿茂臻在采访中隐晦表示“战术安排需要更多沟通”，巴力斯塔则因出场时间问题与他产生隔阂，连一直支持他的门将萨沙，也在一次战术分歧后公开表达异议。 2000年9月13日，成为桑特拉奇在中国的终点。在联赛仅排名第五、足协杯无缘四强的糟糕战绩下，鲁能俱乐部召开紧急新闻发布会，宣布由足校总教练可可维奇接任主教练。当邵克难念出下课声明时，桑特拉奇并未出席，据当时在场的记者回忆，俱乐部办公室里堆放着他尚未打包的行李，其中还包括1999年双冠王的纪念奖杯。 离开济南时，没有了当初的夹道欢迎，只有寥寥数名记者在机场送行，他脸色阴沉地拒绝了所有采访，登机前只留下一句“中国足球的水太深”。
