1948年6月，开封解放前夕，河南大学做出一个破天荒的决定，举校南迁，三千多名师生在校长带领下转移到了苏州。正是这一举措将河南大学彻底钉上了历史的耻辱柱。 河南大学前身是1912年林伯襄在开封贡院旧址创办的河南留学欧美预备学校，1923年改称中州大学，1927年并入政法和农业专科学校，1928年增设医科，成为文理法农医齐全的综合大学。1930年代发展顺利，1934年土木工程系并入北洋大学。1937年抗日战争爆发，学校迁至嵩县办学五年，后转潭头。1944年5月，日军进攻潭头，造成十多名师生伤亡，畜牧系转至西北农学院。这段颠沛时期中断了学校正常节奏，1945年底才返回开封。1948年6月，开封战役爆发，校园受国民党军队破坏，教学秩序混乱。校长姚从吾接到国民政府教育部电报，要求学校南迁苏州，9月1日前未到者除名。他召集会议决定执行，三千多名师生分批出发。第一批于6月中旬从开封经火车和步行前往苏州，途中设接应站。姚从吾带队，途经南京汇报并领取资金。迁徙过程混乱，一些师生掉队或生病，书籍仪器丢失不少。到达苏州后，借用东吴大学和当地中学场地，10月10日开学，使用纯一中学和苏州中学部分建筑作为校区。这次迁校导致学校分裂，留下部分在宝丰组建中原大学，后迁武汉，而苏州部分成为“老河南大学”，声誉受损，被视为逃避现实。 1948年开封战役中，国民党军队进驻河南大学校园，破坏设施，强征师生，导致学校无法正常运转。教育部指令迁校苏州，以维持教学。河南大学遵从行政命令，实属无奈，但此举加剧了师生分裂。约287名进步师生留在中原，另有数十人加入，共三百多人辗转至宝丰县筹建中原大学。南迁的师生超过两千人，在苏州借怡园设校本部，包括校长室和各处室。苏州办学期间，学校租用吴县中学、纯一中学等场所，分设文学院、理学院等院系。1948年10月10日举行开学典礼，恢复教学。但迁校争议大，许多人批评学校脱离中原，忽略了当地形势。这段历史反映了时代转折下高校的困境，河南大学从综合性大学走向分裂。 南迁苏州后，河南大学在当地租借场所办学，文学院设于吴县中学，理学院在纯一中学，法学院在景海女中，农学院在振华女中。校本部位于怡园，行政会议在此举行。1948年下半年，学校面临资金短缺，教育部拨款有限，教学条件简陋。师生生活艰苦，但坚持上课。1949年春，苏州解放，学校1200多名师生于7月乘专列返回开封，与中原大学医学院、教育系和河南行政学院合并，重组新河南大学。这次返回标志着迁校结束，但学校已元气大伤。迁校事件让河南大学历史蒙上阴影，影响深远。 河南大学南迁源于1948年开封战役的战乱，国民党军队占领校园，摧毁建筑，教学中断。教育部电令要求全校迁苏，校长姚从吾执行指令，避免学校解散。但迁校过程中，部分师生选择留下，体现出不同政治取向的分歧。苏州办学虽短暂，却维持了部分学术 continuity。返回开封后，学校面临重建挑战。1951年院系调整，中原大学拆分出中南艺术学院、中南民族学院等，教育学院并入华中大学，1953年政法学院成中南政法学院，中原大学撤销。这些部分发展成武汉音乐学院、湖北艺术学院、广州美术学院、中南民族大学、华中师范大学、中南财经政法大学等院校。河南大学原有强科散失，影响了其综合实力。 1952年院系调整，河南大学农学院独立为河南农学院，医学院成河南医学院，行政学院成河南政法管理干部学院。水利系并入武汉水利学院，财经系并入中南财经学院，植物病虫害专业并入华中农学院，畜牧兽医专业并入江西农学院，土木系和数学专业并入湖南大学。1955年，学校改称开封师范学院，分开封一院和新乡二院，后新乡独立为新乡师范学院。学校从综合大学转为师范院校，丢失农医法工等优势学科。这些散出的系科在外省高校发展强劲，如武汉大学、中南财经政法大学、华中农业大学、江西农业大学、湖南大学、西北农林科技大学、北洋大学等如今在全国前列。新河南大学重建学科起步晚，基础薄弱，与老校遗产相比差距明显。 姚从吾辞职后前往台湾，继续在台湾大学历史系任教，专注边疆史研究，著有多本相关书籍，如《东北史论丛》。1952年当选中研院院士，直至1970年逝世。他未返回大陆，迁校决定成为其生涯争议点。河南大学历史如国家从民国到当代的变迁，拆分重组频繁。原有农科并入河南农业大学、华中农业大学、江西农业大学、西北农林科技大学，这些学校农学领域领先。医科并入郑州大学，法学并入中南财经政法大学，工科并入武汉大学、湖南大学、北洋大学。河南大学虽努力发展，但底子薄，至今未入选211工程，与1912年创办时的基础关系疏远，历史曲折让人感慨。
